<div dir="ltr">Hi there,<br><br>When we tried to use the <i><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>charm</i> command with SimNIBS 4, it gave an error and suggested to use the <i><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>--forceqform</i> option. We then used the following charm command:<br><br><i><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>charm subj T1.nii.gz T2.nii.gz --forceqform<br></i><br>It kept giving an error of "<b><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>numpy.linalg.LinAlgError: SVD did not converge</b>"<br><br>Below are the details:<br><br>Version: SimNIBS 4.0 beta 1 for linxu<br>OS: Ubuntu 20.04.4 LTS<br>Command: charm subj T1.nii.gz T2.nii.gz --forceqform<br><br>Error message:<br>...<br><i><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>Read mesh collection: /data/m2m_M87144843/segmentation/atlas_level2.txt.gz<br>Transforming points<br>Transforming points<br>Read mesh collection: /data/m2m_M87144843/segmentation/atlas_level2.txt.gz<br>Read mesh collection: /data/m2m_M87144843/segmentation/atlas_level2.txt.gz<br>Constructing image-to-world transform from header information (/opt/SIMNIBS/simnibs_env/lib/python3.9/site-packages/simnibs/segmentation/atlases/charm_atlas_mni/template.nii)<br>Read image: /opt/SIMNIBS/simnibs_env/lib/python3.9/site-packages/simnibs/segmentation/atlases/charm_atlas_mni/template.nii<br>Read mesh collection: /data/m2m_M87144843/segmentation/atlas_level2.txt.gz<br><b><span class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small"></span>[ simnibs ]CRITICAL: Uncaught exception<br>numpy.linalg.LinAlgError: SVD did not converge</b></i><br><br><br>Any clue?<br><br>Thanks,<div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">--<br>Mo Chen, PhD<br><br>Clinical Scientist<br>Neuroscience Research Program, Research Department<br>Gillette Children's Specialty Healthcare<br><br>Adjunct Associate Professor<br>Department of Psychiatry and Behavioral Sciences<br>University of Minnesota<br><br>Technical Consultant<br>Non-invasive Neuromodulation Laboratory<br>Brian Conditions, MnDRIVE Initiative<br>University of Minnesota<div><br></div><div><span style="color:rgb(34,34,34)">The information transmitted in this e-mail is intended only for the person or entity to which it is addressed and may contain confidential and/or privileged material, including "protected health information." If you are not the intended recipient, you are hereby notified that any review, retransmission, dissemination, distribution, or copying of this message is strictly prohibited. If you have received this communication in error, please destroy and delete this message from any computer and contact me immediately by return e-mail.</span><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>