<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I just wanted to add a couple of details here.  We are using Brainsight to acquire the Coil Position, and that looks spot on. But we are interested in correctly orienting the coil before running the model. The documentation was rather sparse here. </div><div><br></div><div>Also, Grace is alluding the fact that when we make changes to the Reference Coordinates, it makes changes to the Coil Position.  Not sure what this is about?</div><div><br></div><div>Thanks for your help!</div><div><br></div><div>/cc</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Apr 15, 2022 at 12:48 PM Grace Hallenbeck <<a href="mailto:geh261@nyu.edu">geh261@nyu.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear simnibs crew,<div><br></div><div>Hello! My name is Grace Hallenbeck and I'm a post-doc working with Clay Curtis (cc'ed here) at NYU. We're interested in using simnibs to model the effects of TMS and today we've been trying to correctly position the coil orientation in the simnibs gui but are having some difficulty. <br><br>We have a coordinate of interest that we're plugging in for the x,y,z 'Position' fields. But we're unclear on the best way to work with the 'Direction Reference' coordinates, which is what we think controls the coil orientation. In the screenshot below, I've plugged in the same x,y,z coords as in 'Position', but this has the coil handle (as I understand, 180 deg opposite the green line) pointing slightly off the coil orientation we actually applied TMS at with this subject (what we are attempting to model). <br><br>So our question is: how can we finely modulate the coil orientation, keeping the 'Position' x,y,z coords constant? We would greatly appreciate any help on this as we're getting a publication ready and hope to include some modeling results.  </div><img src="cid:ii_l20ni8xp0" alt="Screen Shot 2022-04-15 at 12.32.29 PM.png" width="406" height="348" style="margin-right: 0px;"><br><br>All the best & thanks for your work,<div><br></div><div>Grace Hallenbeck</div></div>
</blockquote></div>