<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>Indeed a great question from Stephen. I would also like to ask a similar question. Is there any way to include pathological abnormalities like in Alzheimer's disease and MCI (Loss of Neural tissue mass)?  How we can relate the generated E-field for validation and their effects on physiological/ neuronal/ functional changes within the target area. <br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><div><span style="color:rgb(56,118,29)"><font size="2">-----------------------------------------------------------------------------------------------------<br>UTKARSH V. PANCHOLI<br></font></span></div></div></div><br></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Sep 20, 2021 at 12:34 PM Stephen Hogg <<a href="mailto:SHogg@emvision.com.au">SHogg@emvision.com.au</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Hi,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Thanks for making SimNIBS, it's a great program. I was wondering if I could ask a few questions about including pathologies in the outputs. Specifically, I have a region of the brain that I want to overwrite with a tissue type not produced by SimNIBS itself
 (e.g. tumour tissue). In order to include the tumour tissue in the meshes, do I need to add an extra .nii file in the mask_prep directory after updating the existing masks? If so, are there any considerations I should be aware of? How is the new tissue type
 incorporated in mesh generation? Hope this isn't a bother, would greatly appreciate any light you could shed on this.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Regards,<br>
Stephen</div>
</div>

_______________________________________________<br>
Simnibs-discuss mailing list<br>
<a href="mailto:Simnibs-discuss@drcmr.dk" target="_blank">Simnibs-discuss@drcmr.dk</a><br>
<a href="https://mailman.drcmr.dk/mailman/listinfo/simnibs-discuss" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.drcmr.dk/mailman/listinfo/simnibs-discuss</a><br>
</blockquote></div>